Doctor Eggman

El enemigo más acérrimo de Sonic es sin duda alguna el Doctor Eggman, más conocido por algunos como Doctor Bill Gates. En los inicios de la saga, Sonic luchaba con Eggman porque éste capturaba a los animales de su isla y los introducía en el interior de una extensa gama de robots, los Badniks. Eggman es un gran científico autoproclamado "genio" que intenta, por medio de numerosas máquinas, conquistar el mundo, y crear un imperio. Sin embargo, Sonic, ya sea sólo o con sus amigos, lo evita, usando el poder de las Esmeraldas del Caos, y la Master Emerald. En los últimos juegos, Eggman ha cambiado su "mecánica" para conquistar el mundo, actualmente tiene tendencia a utilizar naves de batalla enormes. Desde el Death Egg, pasando por el Egg Carrier, o la Egg Fleet, (en Sonic Heroes). Ha utilizado incluso bombas nucleares.